もし、今ページを見ている人が
bootstrapを使っている心当たりがあって、
jQueryの動作がうまくいかない（読み込まれない）と感じている方であれば、
対処法になると思います。
どうやらbootstrapを使うと、jsの読み込みがapplication.html.erbの下段に移動してしまう。
これが原因で、jsがうまく作動されなくなってしまったようです。
てことで、views/layouts/application.html.erb下にあった
<%= javascript_include_tag "application" %>を
とスタイルシートのすぐ後ろに置いてやります。
これで問題なく作動しました。